二者有区别，主要区别是，意思不同、侧重点不同、用法不同，具体如下：

一、意思不同

1、妙笔生花

妙笔生花，一般指梦笔生花，意思是比喻写作能力大有进步。也形容文章写得很出色。

2、生花妙笔

比喻杰出的写作才能或绘画才能。

二、侧重点不同

1、妙笔生花

比喻写作能力。

2、生花妙笔

比喻绘画才能。

三、用法不同

1、妙笔生花

动宾式，作谓语、补语。含褒义。

2、生花妙笔

偏正式，作谓语。含褒义。